El mercado Común Centroamericano en 50 años sólo ha avanzado dos estadios del proceso de integración, debido a:

ü Falta de consenso entre los gobiernos de cada uno de los países que integran este proceso, ya que solo piensan en sus intereses y no le toman importancia a la integración debido a que los países integrados pertenecen a la periferia.
ü Los países integrados se preocupan mas por hacer tratados con países desarrollados, ya que estos les condonan deudas, les brindan donaciones, entre otros.
ü Otra de las causas, una de las mas significativas es la guerra, la cual fue un gran obstáculo para continuar el proceso, ya que después de esta fue difícil reanudar actividades y por ende continuar con los demás estadios.
ü Con la introducción del CAFTA, los países centroamericanos se preocuparon más por este tratado que por culminar la integración centroamericana, por las oportunidades que les ofrece el tratado del libre comercio.
ü Por la dificultad que presentan para coordinar las políticas fiscales y monetarias, ya que hay diferentes monedas en los países integrados por lo que es difícil ponerse de acuerdo para el uso de una moneda única debido a los tipos de cambio de cada moneda, lo que muchas veces suele ser desventajoso para estos países.